Nauki medyczne (2)
Wykorzystanie programu IDL w naukach medycznych w Centrum Badawczym Moffitt Cancer Research
Droga wędrujących cząstek beta jest rejestrowana i zapisywana w formie obrazów. Z uwagi na fakt, że wyniki są rozmyte, dr Velthuizen wykorzystał jedną z technik cyfrowego przetwarzania obrazów. Techniką tą jest konwolucja, która pozwala niejako na wyostrzenie obrazu i w ten sposób na śledzenie cząstek beta. W innym projekcie, z użyciem podobnych technik, naukowcy laboratorium rozróżnili zdrową tkankę mózgu od blizn i nowotworów.
Dr Velthuizen stworzył aplikację w IDL, która pozwala na tworzenie wyostrzonych obrazów tkanek ludzkich. W projekcie dotyczącym raka mózgu, laboratorium wykorzystało obrazy uzyskane z rezonansu magnetycznego mózgu i podzieliło je w IDL celem identyfikacji miejsc nowotworów, a następnie zobrazowania ich w formie obrazów 3D. Środowisko IDL zapewniło aplikacji elastyczność i możliwość jej ciągłej rozbudowy. Wbudowane widgety IDL umożliwiły opracowanie przejrzystego interfejsu aplikacji, tak aby jego użytkowanie przez naukowców było jak najbardziej ergonomiczne.
Opis problemu
Pracownicy Moffitt Cancer Center oraz instytutu badawczego poszukiwali oprogramowania, które wspomagałoby stawianie lepszych diagnoz raka płuc i raka piersi.Zrealizowane rozwiązanie
Dr Robert Velthuizen, który specjalizuje się w diagnostyce raka piersi i płuc w oparciu o badania mammograficzne i rentgenowskie klatki piersiowej szukał narzędzia, które wspomagałoby stawianie lepszych diagnoz. W jednym z jego projektów, radionuklidy dołączane są do przeciwciał i przenoszone do miejsca gdzie znajduje się nowotwór. Energia wyzwalana z rozkładu beta niszczy guza.Droga wędrujących cząstek beta jest rejestrowana i zapisywana w formie obrazów. Z uwagi na fakt, że wyniki są rozmyte, dr Velthuizen wykorzystał jedną z technik cyfrowego przetwarzania obrazów. Techniką tą jest konwolucja, która pozwala niejako na wyostrzenie obrazu i w ten sposób na śledzenie cząstek beta. W innym projekcie, z użyciem podobnych technik, naukowcy laboratorium rozróżnili zdrową tkankę mózgu od blizn i nowotworów.
Dr Velthuizen stworzył aplikację w IDL, która pozwala na tworzenie wyostrzonych obrazów tkanek ludzkich. W projekcie dotyczącym raka mózgu, laboratorium wykorzystało obrazy uzyskane z rezonansu magnetycznego mózgu i podzieliło je w IDL celem identyfikacji miejsc nowotworów, a następnie zobrazowania ich w formie obrazów 3D. Środowisko IDL zapewniło aplikacji elastyczność i możliwość jej ciągłej rozbudowy. Wbudowane widgety IDL umożliwiły opracowanie przejrzystego interfejsu aplikacji, tak aby jego użytkowanie przez naukowców było jak najbardziej ergonomiczne.
Korzyści
- IDL zapewnił elastyczność i pozwolił importować pliki z różnych skanerów, w różnych formatach plików oraz umożliwił export danych w formacie PostScript do celów prezentacyjnych
- Wykorzystanie IDL wymagało napisania 20% mniej linii kodu, niż byłoby to konieczne w językach Fortran lub C/C++
- Jednym z głównych założeń dr Velthuizen'a było zapisanie dostępnych algorytmów, dlatego uznał on IDL za najbardziej elastyczne narzędzie do obliczeń i przetwarzania obrazów
